Markeri su podijeljeni u dvije vrste: na bazi vode i na bazi ulja.
Slično obojenim olovkama, olovke na bazi vode nisu otrovne, ali ih nije lako osušiti. A pokrivenost nije dobra, površina nekih predmeta se ne može napisati, a dvije boje će izgledati prljavo kada se naslažu zajedno.
Olovke na bazi ulja su sintetička otapa koji koriste alkohol za rastvaranje boje, a nekim osjetljivim osobama će se osjećati vrtoglavica kada ga nanjuše. Ali lako je pisati i suha, ima dobru pokrivenost, i manje je skupo.
Postoje i neki markeri koji dolaze sa voćnim mirisom.
